报告题目:
Integrating human protein-protein interactome, disease-associated mutations, drug responses, and patient survival for personalized medicine
报告时间:
2024年10月31日(周四)14:00-15:00
报告地点:
九龙湖医工楼518报告厅
报告摘要:
随着计算生物学和精准医疗的迅速进步,蛋白质与蛋白质之间相互作用的研究变得越来越广泛和深入。蛋白质是细胞内执行生物学功能的重要分子,它们之间通过相互作用形成复杂的网络,而这些网络的异常与多种疾病的发生密切相关。大多数蛋白质通过不同的相互作用界面与不同的蛋白质发生相互作用,从而行使不同的功能。此外,与疾病相关的突变常常富集在蛋白质蛋白质相互作用界面上。结构生物学的发展,如X射线晶体学、核磁共振和冷冻电镜技术,使科学家能够解析越来越多的蛋白质结构,从而为理解蛋白质如何相互作用提供了关键信息。然而目前绝大多数的蛋白质蛋白质复合物结构仍然未知。计算生物学的发展,特别是深度学习技术的应用,为蛋白质蛋白质相互作用界面的确定和疾病关联研究等提供了新的工具,这些研究也为个性化医疗提供了重要的指导意义。同时,大规模生物医学数据库的建立,如蛋白质结构数据库和人类基因突变数据库等,为大数据分析提供了丰富的资源,帮助研究人员发现新的生物学规律和潜在药物靶点。本报告将讨论和分享在这些领域内的一些研究工作。
报告人简介:
熊大鹏博士,目前在康奈尔大学计算生物学系做博士后研究工作,具有计算数学,计算机和生物学等多学位背景。主要从事机器学习,人工智能及相关的计算生物学和生物医学大数据处理研究,研究课题目前聚焦于基于人工智能的蛋白质蛋白质相互作用界面的预测研究,并基于此构建全人类的蛋白质相互作用组,通过计算分析研究突变对疾病发生的影响以及所导致的全人类蛋白质组的扰动。以第一作者或通讯作者在Nature Biotechnology, Communications Biology,Bioinformatics等期刊发表论文10余篇。在IEEE Transactions on Multimedia等期刊审稿30余篇,并担任多个期刊或会议的客座编辑服务。获湖南省“芙蓉学者”,博士研究生国家奖学金,清华大学结构生物学高精尖创新中心优秀奖,湖南省优秀硕士学位论文,湘潭大学校长奖等奖项。